16路（南京西站→新和源装饰城站）
南京西站 - 热河路 - 盐仓桥广场西 - 萨家湾 - 三牌楼 - 虹桥 - 西流湾公园 - 大方巷 - 鼓楼 - 鼓楼医院 - 珠江路南站 - 新街口南站 - 三元巷 - 内桥 - 三山街 - 长乐路 - 中华门内 - 雨花路 - 雨花台 - 西街(地铁中华门站) - 润泰市场 - 赛虹桥 - 凤台南路 - 新和源装饰城

100路（安德门站→南医二附院总站）
安德门 - 能仁里 - 雨花西路 - 窑湾街 - 钓鱼台 - 新桥 - 升州路 - 张府园 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路北站 - 鼓楼 - 大方巷 - 山西路 - 虹桥 - 三牌楼 - 萨家湾 - 南医大二附院东院 - 盐仓桥广场西 - 挹江门 - 热河南路 - 南医二附院 - 姜家圩 - 姜家园南站 - 南医二附院总站

28路（长途东站→湖西街站）
长途东站 - 省经干院 - 花园路 - 板仓村 - 岗子村 - 锁金村 - 新庄广场南 - 新庄广场西 - 火车站广场东 - 火车站广场西 - 中央门东站 - 中央门南站 - 许府巷 - 玄武湖隧道 - 公交总公司 - 鼓楼北站 - 鼓楼医院 - 珠江路北站 - 新街口南站 - 三元巷 - 张府园 - 建邺路 - 朝天宫 - 水西门 - 长虹路北站 - 长虹路 - 集庆门桥 - 彩虹苑 - 南湖集贸市场 - 南湖路 - 湖西街

33路（雨花台南门站→南京火车站）
雨花台南门 - 望江矶 - 花神庙(雨花台中学) - 紫荆花路 - 宁南小区 - 紫荆花路东 - 卡子门西站 - 养回红村 - 雨花台东门 - 雨花路立交桥 - 雨花路 - 中华门内 - 长乐路 - 三山街 - 内桥 - 三元巷 - 新街口南站 - 珠江路北站 - 鼓楼医院 - 鼓楼北站 - 玄武湖公园 - 公交总公司 - 玄武湖隧道 - 中央门南站 - 中央门东站 - 南京火车站

35路（集庆门站→窑上村站）
集庆门 - 仙鹤街 - 仙鹤桥 - 评事街 - 升州路 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路北站 - 鼓楼北站 - 玄武湖公园 - 公交总公司 - 玄武湖隧道 - 中央门南站 - 中央门北站 - 河路道 - 干休所 - 五百村路 - 五塘村 - 五塘村东 - 旭日景城 - 黄方村 - 窑上村

38路（西街站→南堡公园站）
西街 - 窑湾街 - 钓鱼台 - 新桥 - 升州路 - 张府园 - 三元巷 - 新街口南站 - 新街口北站 - 珠江路 - 鼓楼医院 - 鼓楼 - 玄武湖公园 - 公交总公司 - 许府巷 - 中央门南站 - 中央门北站 - 河路道 - 干休所 - 五佰村路 - 五塘村 - 白云新寓 - 上元门 - 燕江路 - 金陵六村 - 南堡公园

41路（河西金陵中学站→新街口南站）
河西金陵中学 - 白鹭东街 - 怡康街西 - 应天大街 - 安如村 - 沿河村 - 玉塘村 - 大士茶亭 - 莫愁湖公园 - 水西门 - 建邺路 - 张府园 - 三元巷 - 秣陵路 - 王府大街 - 新街口南站

三元巷 公交车站

三元巷公交车站